Předchůdkyní současné katedry primární a preprimární pedagogiky je katedra pedagogiky a psychologie, která byla v různých organizačních formách vždy důležitou
součástí pedagogické fakulty. V některých obdobích existovaly dvě samostatné katedry pedagogiky a psychologie, jindy byla na fakultě jedna katedra společná.
Prvním pokusem osamostatnit pracoviště, které by se zabývalo učitelstvím pro 1. stupeň základního vzdělávání, bylo již od roku 1978 samostatné oddělení pedagogické praxe,
které sdružovalo oborové didaktiky některých vzdělávacích oblastí (přírodovědných předmětů, matematiky, českého jazyka a tělesné výchovy). Oddělení také ideově a organizačně
zajišťovalo praxi studentů učitelství pro 1. stupeň základních škol. Cílem pracoviště byla emancipace oborových didaktik jako vědních oborů. Původně byla snaha sdružit na něm
všechny oborové didaktiky pro celé základní vzdělávání tak, aby příprava učitelů více vyhovovala potřebám praxe. Bohužel se původní záměr nezdařil, protože na řadě kateder nebyli
akademičtí pracovníci, kteří by se zaměřovali na rozvíjení oborové didaktiky. Od 1. září 1989 bylo pracoviště rozpuštěno.
Garanci za studium učitelství pro 1. stupeň ZŠ převzala katedra pedagogiky. V 90. letech ideově i organizačně s určitými obtížemi zabezpečila první akreditaci studijního
programu. Zajišťovala také péči o studenty tohoto programu.
Po roce 1989 se také katedra pedagogiky v reakci na velký zájem odborné veřejnosti ujala akreditace nového studijního programu zaměřeného na přípravu učitelek pro mateřské školy. Akreditace
byla připravena s podporou Střední pedagogické školy v Prachaticích a odborných organizací v Budějovicích. Byla získána v roce 2004. První studentky začaly
studovat v prezenční a kombinované formě studia v akademickém roce 2005. Zájem o studium převyšoval několikanásobně kapacity katedry.
Znovu se objevila myšlenka osamostatnit pracoviště, které by zajišťovalo oba výše zmíněné studijní programy. Ale personální situace na katedře pedagogiky to v té době neumožnila.
Existovaly však neformální skupiny, které se zaměřovaly na učitelství pro 1. stupeň a učitelství pro mateřské školy ve výuce i v tvůrčí činnosti. Obě
tyto skupiny spolupracovaly se samostatnými pracovišti tohoto zaměření, která existovala v Praze, Olomouci a v Ostravě. Ve společných diskuzích se vytvářela koncepce
výuky těchto programů, přijímacích a státních zkoušek.
Od roku 2009 se formálně a posléze i fakticky oddělilo oddělení primární a předškolní pedagogiky v rámci katedry pedagogiky a psychologie. Pracovníci postupně
hledali svá pedagogická a tvůrčí zaměření, tak aby přesvědčivě podpořili realizaci studia v obou programech. Také se hledala společná témata pro tvůrčí práci.
Při poslední reorganizaci katedry pedagogiky a psychologie v roce 2021 byla vytvořena samostatná katedra primární a preprimární pedagogiky.
